Eine mittlerweile weltweit bekannte Verbrecherorganisation, die es sich zum Ziel gemacht hat, die Weltherrschaft an sich zu reißen. Ihre Mitglieder sind allesamt gesuchte S-Rang Nukenin und haben jeder außergewöhnliche Fähigkeiten und sind unglaublich stark.

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Akatsuki wird offiziell von einem Mann namens Pain angeführt, der gleichzeitig auch als Anführer Amegakures auftritt.

Insgesamt gibt es (zu Beginn von Lignium Adpetentiae) zehn agierende Mitglieder, die bis auf Zetsu in seiner Funktion als Spion, in taktisch ausgewählten Zweierteams agieren, deren Fähigkeiten sich so ergänzen, dass sie ihre Kampfkraft maximieren.

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Um ihre Ziele zu erreichen will Akatsuki alle Biju fangen und deren unglaublich starkes Chakra mithilfe einer speziellen Technik in einer Statue versiegeln, um es für sich nutzen zu können. Infolge dieses Prozesses wird der Biju aus seinem Jinchūriki extrahiert, der an den Folgen stirbt.

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Erkennungszeichen der Mitglieder Akatsukis, sind die einheitlichen schwarzen Mäntel mit roten Wolken, sowie das Stirnband ihres Heimatdorfes, allerdings mit durchgestrichenem Zeichen, als Hinweis auf ihre Abtrünnigkeit und Entsagung ihrer Loyalität gegenüber dem Dorf.